什么是DNA外链?
DNA外链指的是由一条双链DNA分离形成的单链DNA。在PCR扩增等实验中,需要在DNA外链上加上引物才能进行下一步反应。而DNA外链引物也分为内链引物和前导链引物两种。
什么是DNA内链引物?
DNA内链引物是一种在DNA外链上配对杂交接入DNA链的特殊引物,其序列与所需扩增序列相同。一般来说,内链引物的长度在20到25个核苷酸之间。在PCR扩增反应中,内链引物紧贴于所需扩增序列左右几个核苷酸的位置上,等PCR反应达到一定温度后,再沿着DNA链参与反应。内链引物比外链引物对于PCR扩增更加具有特异性和灵敏度,它是PCR成功的关键之一。
什么是DNA前导链引物?
DNA前导链引物是指由一条单链DNA嵌合物反转而产生的单链DNA引物。该引物序列与所需扩增序列相同,但长度较内链引物短。前导链引物与扩增产品具有相同方向,所以在PCR反应中无需通过扩增产物和内链引物形成杂交。此外,由于DNA前导链引物在PCR反应的早期阶段就能结合目标序列快速进行扩增,因此其扩增速率得到大幅提升。
如何选择适合的引物?
在PCR反应中,选择适合的引物是决定实验结果的重要因素。通常来说,引物应该是以下几个特点:能够专一地结合目标序列、序列长度应控制在20-25个核苷酸、不含有重复结构(避免在扩增中产生多态性)、两个引物在扩增时应具有具有相同的扩增效率。同时,针对比较困难的目标,还可以利用特定设计引物技术来开发出更好的引物。