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树外链,系统发育树外群

树外链,系统发育树外群

什么是树外链?

树外链,简称OTU(Outgroup Taxon Unit),是指在系统发育学中用来建立系统发育分支演化关系的群组。它通常被认为是与研究对象不同的物种或组中的物种。

为什么需要用树外群?

在建立系统发育树的过程中,使用树外群可以帮助确定目标物种在系统发育树上的位置。由于树外群与研究对象具有较远的进化距离,因此它们通常具有较少的共同祖先,这使得使用它们建立对比模型更加可靠。

如何选择树外群?

选择树外群时需要根据研究对象的进化历史考虑。一般来说,选择与研究对象生态环境和形态学特征有一定距离的物种作为树外群更为合适。同时,树外群的数量也应该足够,以确保研究结果的可靠性。

使用树外群有什么注意事项?

在使用树外群建立系统发育树时需要注意,选取的树外群不能是具有进化不稳定性的物种,例如受人类干扰或强烈环境变化影响的物种。此外,需避免使用过深的树外群,以免因过于遥远而对建树的分支插入产生负面影响。

树外链在实际研究中的应用有哪些?

树外链在生物学、生态学、进化学和分子生物学等领域的应用十分广泛,例如在研究物种间的亲缘关系、基因重组活动及演化速度、蛋白质结构演化和许多其他的领域中都有应用。它们对研究生物的进化和系统发育关系发挥重要作用。

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